Koleksi Muzium Bandar Yumen dibahagikan kepada lebih daripada sedozen kategori, termasuk tembikar, barangan perak, barangan gangsa, barangan batu, barangan tulang, barangan kayu, porselin, barangan jed, dan bata yang dicat. Ia dicirikan terutamanya oleh artifak Budaya Huoshaogou dan Budaya Kuda yang Dikasari. Ia juga mengandungi artifak dari zaman Han, Wei-Jin, Ming-Qing, yang membentuk asas koleksi muzium.